青岛崂山区网站建设,中远建设集团有限公司网站,wordpress怎么改图标,上杭网站设计R的多进程使用与改进在R中需要使用多进程时#xff0c;常见方案是使用foreach和doParallel的组合。foreachforeach包中最重要的是foreach函数#xff0c;该函数创建一个foreach对象#xff0c;随后串行或并行的执行表达式。library(foreach)?foreachout:foreach( ..., .c… R的多进程使用与改进在R中需要使用多进程时常见方案是使用foreach和doParallel的组合。foreachforeach包中最重要的是foreach函数该函数创建一个foreach对象随后串行或并行的执行表达式。library(foreach)?foreachout:foreach( ..., .combine, .init, .final NULL, .inorder TRUE, .multicombine FALSE, .maxcombine if (.multicombine) 100 else 2, .errorhandling c(stop, remove, pass), .packages NULL, .export NULL, .noexport NULL, .verbose FALSE)e1 %:% e2when(cond)obj %do% exobj %dopar% extimes(n)foreach函数在创建时常用的几个参数为...: 表达式中使用的变量。.packages: 表达式依赖的包字符向量。.export: 表达式依赖的变量字符向量。.combine: 运算后结果的组合方式默认为列表可选 c cbind rbind *等。.errorhandling: 当运行中出现错误时的处理方式。使用时对象后接%do%为串行%dopar%为并行。foreach(i1:3) %do% sqrt(i)out:[[1]][1] 1[[2]][1] 1.414214[[3]][1] 1.732051当使用%do%执行时程序将会自动忽略.packages与.export变量。如果需要使用多进程不只需要更换成%dopar%你还需要注册集群执行结束集群。library(doParallel)cl makeCluster(4) #注册4个进程的集群registerDoParallel(cl)foreach(i1:3) %dopar% sqrt(i)stopCluster(cl) # 记得结束集群包装对多进程进行包装形成runParallel函数。library(foreach)library(doParallel)runParallel function(FUN,PARAMS,packages NULL,export NULL){ cl makeCluster(4) registerDoParallel(cl) N length(PARAMS) R foreach( i 1:N, .packages packages, .export export, .errorhandling stop ) %dopar% { r do.call(FUN, PARAMS[[i]]) r } stopCluster(cl) R}程序中的do.call能够使用提供的参数运行FUN函数。runParallel函数传入FUN与并行参数的列表集合PARAMS就可以使用FUN对每个值进行处理然后返回全部值。问题在实际使用中遇到这样一个问题在这里把问题稍微简化一下。有两个文件do_some_thing.R和do_some_other_thing.R里面各自编写了一个函数。do_some_thing.Rdo_some_thing function(x){ do_some_other_thing(x**2)}do_some_other_thing.Rdo_some_other_thing function(x){ x / 2}很明显do_some_thing.R中引用了do_some_other_thing.R中的函数。现在我source这两个文件并暴露这两个函数编写一个函数调用do_some_thing。some_thing new.env()source(do_some_thing.R,local some_thing)some_other_thing new.env()source(do_some_other_thing.R,local some_other_thing)attach(some_thing)attach(some_other_thing)fun function(x){do_some_thing(x1)}然后进行多进程调用。params lapply(1:10, list)runParallel(fun,params)得到错误。Error in { : task 1 failed - 没有do_some_thing这个函数找不到do_some_thing函数然而当我们加上所有可能的.export变量后。runParallel(fun,params,exportc(do_some_thing,do_some_other_thing,some_thing,some_other_thing))仍然失败。 Error in { : task 1 failed - 没有do_some_other_thing这个函数 有趣的是找不到的函数变成了do_some_other_thing然而我明明export这个变量了啊。在搜索中回答普遍认为doParallel存在设计缺陷它不能顺利的找到函数内调用的其他自定义函数。在不停的搜索过后我终于找到了一个解决方案使用doFuture包[1]。doFuture包会自动解决这类依赖问题无需提供.packages和.export参数同时无需手动结束集群。一个更改后的版本是这样的。runParallel function(FUN,PARAMS){ registerDoFuture() plan(multisession, workers 4) #在这里指定进程数 N length(PARAMS) R foreach( i 1:N, .errorhandling stop ) %dopar% { r do.call(FUN, PARAMS[[i]]) r } R}runParallel(fun,params)out:[[1]][1] 2[[2]][1] 4.5······成功。十分推荐doFuture包我我是 SSSimon Yang关注我用code解读世界References[1] doFuture包: https://github.com/HenrikBengtsson/doFuture
